Die Kathedrale Santa Mara de Sigüenza und die Mudéjar-Kirche Santa Mara de la Fuente la Mayor bilden die beiden Bischofssitze der Diözese Sigüenza-Guadalajara. Mit dem Bau der Kirche wurde um das Jahr 1300 begonnen. Mit einem zentralen Säulengang mit Hufeisenbogen und zwei flankierenden Säulengängen mit Rundbögen ist der Innenraum in drei Schiffe unterteilt. Besonders hervorzuheben ist das große Altarbild von Francisco Mir im Stil der manieristischen Renaissance. Eine Glocke stammt aus dem 18. Jahrhundert, zwei weitere aus dem 19. und die übrigen fünf wurden im 20. Die Kirche gehört zu den am meisten verehrten Kirchen der Stadt und ist ein Ort von spiritueller Bedeutung.

Das Äußere der Kirche ist seit ihrer Erbauung weitgehend unverändert. Der Hauptzugang zum Gebäude befindet sich auf der Seite, die der Plaza de Santa Mara zugewandt ist. Eine weitere Tür befindet sich an der Südwand, und eine dritte, heute nicht mehr zugängliche Tür ist in der Wand der ehemaligen Sakristei zu sehen, die mit dieser Seite der Kirche verbunden war. Die spitzen Hufeisenbögen dieser Türen sind charakteristisch für den Mudéjar-Stil, der in ganz Syrien zu finden ist.

Die Bögen bestehen aus radial angeordneten Ziegeln, die von einer Ziegelschicht eingefasst werden, die abschnittsweise einfache Schleifen bildet, von denen einige grüne Keramikstücke enthalten. Sie werden von gedrungenen Pfeilern eingerahmt, und der westliche Alfiz ist mit strahlenförmig angeordneten Ziegelvorsprüngen verziert, die in der Mitte der Tür zusammenlaufen. Diese Vorsprünge spiegeln das Design der Eingangstür selbst wider und dienen als Pfosten aus demselben Material. Eine Nachbildung des Haupttors wurde in der ehemaligen Sakristei angebracht.

Eine Arkade aus dem frühen 16. Jahrhundert im Renaissance-Stil von Alcarria stützt die Wände im Süden und Westen. Die Außenwände der Kirche bestehen aus Mauerwerk, während die Innenwände aus Ziegeln bestehen, die durch verschiedene Verputzarten voneinander getrennt sind. Die quadratische Laterne des Querschiffs, die an der Wende zum 17. Jahrhundert errichtet wurde, besteht wie der Rest der Kirche aus Backstein.

Der Turm dieser Kirche ist an der Südwand in der Nähe des Altarraums angebracht. Es gibt Hinweise darauf, dass er früher vom Rest der Kirche abgetrennt war. Es handelt sich um ein quadratisches Gebäude mit dicken Backsteinmauern, die nur an zwei Stellen durch schmale Schießscharten unterbrochen werden, die Licht auf die faszinierende Treppe werfen, die zu den Glocken hinaufführt, die von hoch aufragenden Rundbögen geschützt werden, die wiederum von reich mit Spielen und Kombinationen verzierten Backsteinreihen eingerahmt werden. Über diesem Teil aus dem 16. Jahrhundert erhebt sich ein neuerer Teil, der in einer Turmspitze im Madrider Stil gipfelt und von einem Gesims, ebenfalls aus Backstein, gekrönt wird.

Sie ist durch massive Pilaster und Rundbögen in drei Schiffe unterteilt, hat ein Querschiff, das von einer Kuppel mit einer Laterne gekrönt wird, und ein erhöhtes Presbyterium. Die Decke des Kirchenschiffs wurde mit Gips verkleidet und darüber wurde eine alte Mudéjar-Kassettendecke gefunden, die sorgfältig konserviert wurde. Im Untergeschoss der Kirche ist ein Chorraum zu sehen.

Auf beiden Seiten gibt es Kirchen mit Kapellen. Die Kapelle der Familien Figueroa und Torres befindet sich an der Stelle der ehemaligen Sakristei im Hauptschiff. Mehrere Grabsteine und ein schöner Marmoraltar aus dem 19. Jahrhundert erinnern an die verstorbene Adelsfamilie. Die Heimsuchungskapelle, die 1480 von Don Alonso Yáez de Mendoza, einem Vorfahren des Kardinals Mendoza, erbaut wurde, befindet sich an der Stirnseite dieses Kirchenschiffs. Die alte Kapelle ist längst verschwunden, übrig geblieben ist nur die liegende Alabasterstatue einer Frau in religiösem Gewand und mit betenden Händen. Die neoklassizistische Nische mit dem Wappen von Yáez mit Kapuze wurde im 18. Jahrhundert von einem Nachkommen errichtet, während der Rest eine spätere Ergänzung ist.

Sowohl Juan Sánchez Hurtado, Kommissar der Inquisition und Priester von Santa Mara im Jahr 1636, als auch Manuel de Albornoz y Sotomayor, ein weiterer Priester der Kirche und Stifter des Hochaltars im ersten Viertel des 17. Jahrhunderts, werden durch Grabsteine im Evangelienschiff geehrt, die jeweils ein Wappen tragen. An dieser Wand befindet sich ein Gemälde der Virgen de la Varga. Die Kapelle der Familie Santsimo, die von der Familie Guzmán an der Wende zum 16. Jahrhundert gegründet wurde und in der alle ihre Mitglieder bis zur Wende zum 19. Das polychrome Guzmán-Wappen ziert das Portal, während das Innere der Kapelle mit mehreren riesigen Wappen geschmückt ist, die die verschiedenen Verbindungen der Familie und diese Legende darstellen:

Die M.N. Cavo don Lus Guzmán und Mara de Guzmán, seine Frau, SSres. de la Villa de Alvolleque Lugar de Burramiento y descanso und ihre Suzesores in ihrem Haus und Mayorazgos, stifteten diese Kapelle zu Ehren Unserer Lieben Frau des Friedens und der Barmherzigkeit, damit sie, ihre Kinder und alle anderen Personen, die sie im Tod für würdig erachten, hier ihre letzte Ruhestätte finden können.

Das Mittelschiff unter dem Presbyterium ist mit Grabsteinen und Grabsteinfragmenten übersät.

Im Presbyterium können die Besucher einen polychromen plateresken Altaraufsatz und eine Kanzel bewundern. Der aus Guadalajara stammende Don Juan Morales wurde hier begraben, und sein Grab ist an der Evangelienwand zu sehen. Eine Statue des Stifters aus dem späten 15. Jahrhundert, der auf einem Kissen kniet und eine Haube trägt, während er betet, befindet sich unter einem zeitgenössischen Arkosolium. Vor ihm befindet sich ein schönes Halbrelief, das die Auferstehung mit vier Personen und einer Landschaft darstellt. Das Wappen der einzelnen Personen erscheint über den anderen.

Im hinteren Teil des Presbyteriums hängt ein beeindruckendes Altarbild eines anonymen Künstlers aus dem ersten Drittel des 17. Jahrhunderts. Es besteht aus zwei Abschnitten und drei Schiffen, und die Ausstellungsräume sind mit prächtigen Reliefszenen gefüllt, die Ereignisse aus dem Leben der Jungfrau Maria darstellen, wie die Geburt Christi, die Epiphanie und andere, mit einer prächtigen Darstellung der Himmelfahrt Mariens in der Mitte und einem Kalvarienberg oben auf dem Gebäude. Die Kirche ist in ihren Schnitzereien und strukturellen Merkmalen mäßig und elegant ausgeführt und ist im Stil der Renaissance polychromiert.