Die Ursprünge des Gebäudes gehen auf ein ehrgeiziges, unvollendetes Projekt von Pedro Díaz de Palacios, dem damaligen Domherrn von Málaga, zurück, der 1629 mit dem Bau der Kirche San Pedro im Stadtteil Perchel beauftragt wurde, um die alte Pfarrkirche San Juan zu unterstützen. Zu diesem Zweck wurde eine dreischiffige Kirche mit einer Hauptkapelle, einer Sakristei und einem Turm entworfen, die klassische, aus der Renaissance übernommene Zierelemente mit dem Mudéjar-Stil des prächtigen, das Kirchenschiff bedeckenden Fachwerks verbindet. Aus verschiedenen Gründen wurde dieses Projekt nicht vollendet und nur der Bau eines Kirchenschiffs sowie die Vereinfachung anderer Elemente des Chors durchgeführt, und der geplante Turm wurde als Glockenturm belassen, der später durch den bestehenden Glockenturm ersetzt wurde. Im ersten Viertel des 18. Jahrhunderts wurde die monumentale Kapelle des Sagrario im eindeutig barocken Stil errichtet, der dem Meister Unzurrunzaga zugeschrieben wird. Es zeichnet sich durch seine reiche Verzierung aus, die aus üppigen Stuckarbeiten und Gemälden besteht, die dem Maler Diego de la Cerda aus Málaga nahe stehen.

Zu Beginn des 20. Jahrhunderts und nach den Ereignissen von 1931 und 1936, als sich das Gebäude in einem ruinösen Zustand befand, wurde beschlossen, es nach den in den Jahren 1942 und 1943 vom Architekten Enrique Atencia vorgelegten Projekten wieder aufzubauen. Bei der Restaurierung wurde die Struktur der Kirche beibehalten, aber zwei Kapellen wurden hinzugefügt, um die Bilder der Bruderschaft Cristo de la Expiración unterzubringen. Heute besticht das Gebäude durch die Nüchternheit und Monumentalität seiner Formen sowie durch die Schlichtheit seiner prächtigen Fassade aus rötlichem Stein, die sich von der Mauer abhebt. Erwähnenswert sind auch die identitätsstiftenden Werte, die in den letzten fünfzig Jahren durch die Präsenz der Bruderschaft des Cristo de la Expiración verstärkt wurden, deren Titelbilder für einen großen Teil der Bevölkerung von Málaga eine große Kraft der Verehrung und Konzentration haben.

Die Kirche hat eine sehr einfache Konstruktion mit einem einzigen Schiff, das mit einem verstärkten Fachwerk bedeckt ist, das mit Zugstangen verstärkt ist, die auf in die Seitenwände eingelassenen Kragsteinpaaren ruhen.

Die Seitenwand des Altarraums ist mit Holz verkleidet, während der Sockel kahl ist, mit drei Oculi davor. An den Umfassungsmauern befinden sich große, gebogene, meist blinde Rundbögen, die von dorischen Pilastern getragen werden. Der obere Teil der Bögen ist mit Buntglasfenstern versehen.

Die Hauptkapelle hat einen Chor mit einer flachen Stirnwand, die aus einem blinden Rundbogen besteht und ähnliche Merkmale wie die Umfassungsmauern des Kirchenschiffs aufweist.

Das Taufbecken befindet sich an der linken Seite des Altarraums. Sie wurde zwischen 1600 und 1699 aus Kalkstein gefertigt, geschnitzt und poliert. Sie besteht aus einem zylindrischen Sockel mit achteckigem Querschnitt und einem runden Becken mit verehrtem Innen- und Außenbereich.

Zu Füßen des Kirchenschiffs befindet sich der hölzerne Chor, der auf vier Kragsteinen steht, von denen der erste auf zwei Kragsteinen ruht und eine mit Balustraden versehene Brüstung trägt.