Die Kirche San Juan, die auch als Kirche San Nicolás bekannt ist, befindet sich an der Praza do Camiño, einer wichtigen Station des Jakobsweges. Im 12. Jahrhundert ließ sich hier der Orden der Ritter des Heiligen Johannes von Jerusalem nieder, um ein Pilgerhospital zu betreiben.

Die im 13. Jahrhundert errichtete Kirche wurde von einem der wichtigsten Mitarbeiter von Meister Mateo erbaut, der für seine Arbeit an der Kathedrale von Santiago bekannt war. Die Kirche befand sich ursprünglich am Fluss Miño, an einer strategisch wichtigen Stelle des Französischen Weges, wurde aber in den 1950er Jahren wegen des Baus des Stausees von Belesar an ihren heutigen Standort verlegt. Die nummerierten Quadersteine zeugen noch heute von ihrem Wiederaufbau.

Der Tempel hat das Aussehen einer Kirchenfestung mit einem einzigen Schiff und einem halbrunden Chor. Die Hauptfassade, die eine Verteidigungsanlage imitiert, hat Zinnen, Schießscharten und Türme auf beiden Seiten. Es gibt einen großen Bogen, der durch eine Tornalluvia geteilt ist, und eine imposante Fensterrose, eine der größten in Galicien. Der Hauptportikus mit drei verzierten Archivolten ist von der Werkstatt des Meisters Mateo inspiriert. Die innere Archivolte zeigt die vierundzwanzig Ältesten der Apokalypse beim Spielen von Instrumenten, während das schlichte Tympanon die Figur des Pantokrator beherbergt. Die Kapitelle der Säulen sind mit pflanzlichen Motiven verziert.

Die nördlichen und südlichen Seitentüren sind ebenfalls erhalten. Das Tympanon der Nordtür zeigt die Verkündigung, während die Südtür eine Figur mit Mitra und Messgewand darstellt. Beide Türen haben reich verzierte Archivolten.

Das Innere der Kirche ist nüchtern und elegant, mit einem Schiff, das von einem spitzen Tonnengewölbe bedeckt ist, und einem Chor mit Tonnen- und Muschelgewölbe. Eine Fensterrose im Triumphbogen erhellt das Kirchenschiff. Auf jeder Seite flankieren zwei Baldachine den Eingang.

Zwei Wendeltreppen zu beiden Seiten des Hauptportals führen zu einem Korridor unter der Rosette und zu einem zinnenbewehrten Gang, der die vier Türme umgibt.

Die Kirche San Juan de Portomarín gilt als eines der besten Beispiele für die romanische Architektur Galiciens und wurde 1931 zum kunsthistorischen Denkmal erklärt.