L'aire de jeu proprement dite consistait en un ovale de 75 mètres sur 44, mais il s'agissait en réalité d'une plate-forme en bois recouverte d'une couche de sable. Sous cette surface se trouvait un système complexe de tunnels et de cellules connu sous le nom d'hypogée, utilisé pour abriter les gladiateurs, les prisonniers et les animaux. Le sol de l'arène comportait un certain nombre de trappes et d'ascenseurs qui communiquaient avec le sous-sol et pouvaient être utilisés pendant les spectacles.

La conception de l'arène comprenait un système de drainage sophistiqué relié par quatre grands égouts. Initialement, on a suggéré que ces égouts étaient destinés à évacuer l'eau après les événements navals qui avaient lieu. Cependant, il semble que sous le règne de Domitien, l'idée des naumachiae ait été abandonnée et que les égouts aient été pavés pour permettre l'utilisation de chariots élévateurs pour les combats de gladiateurs. Aujourd'hui, la toiture en bois qui existait autrefois a disparu, laissant tout le labyrinthe souterrain complexe exposé à l'air libre.