Le couvent de la Merced, construit entre 1672 et 1723, se trouvait à l'emplacement de cette église. Avec le démantèlement de Mendizábal en 1836, il a été utilisé comme école, usine textile et asile, et a été démoli en 1895. Après cela, et en utilisant une partie de la pierre de l'édifice précédent, la nouvelle église actuelle de Sabugo a été construite, dédiée à Santo Tomás de Canterbury, tout comme l'ancienne petite église du quartier des pêcheurs de Sabugo. Il a été inauguré en 1903 en présence du nonce de Sa Sainteté, Monseigneur Rinaldini et de l'archevêque d'Alcala-Madrid, Monseigneur Guisasola. La construction est le résultat de la croissance de la ville d'Avilés, motivée par la bourgeoisie locale à caractère commercial et industriel et les Indianos de retour, qui a précédé la grande expansion d'Avilés avec la construction de l'aciérie Ensidesa au milieu du XXe siècle. L'initiative revient à Julián García San Miguel y Zaldúa, marquis de Teverga, du parti libéral, et la commande est passée au prestigieux architecte Luis Bellido.

Il s'agit d'une église au caractère néo-gothique et médiéval marqué. Deux tours flèches élancées de 47 mètres se détachent sur sa façade. Le plan au sol a la forme d'une croix latine, de 57 mètres de long et 22,5 mètres de large.

L'intérieur est composé de trois nefs, la centrale étant beaucoup plus haute et dotée d'une claire-voie, séparée des deux autres par des arcs brisés. Les trois nefs sont couvertes de voûtes à nervures. De nombreux retables décorent l'intérieur, œuvre du prestigieux artiste asturien Félix Granda Buylla. La décoration a péri pendant la guerre civile, mais a été remplacée à nouveau par l'atelier de Buylla. L'orgue situé dans le chœur se distingue également.