L'église de San Juan, également connue sous le nom d'église de San Nicolás, est située sur la Praza do Camiño, une étape importante du Chemin de Saint-Jacques. Au XIIe siècle, l'Ordre des Chevaliers de Saint-Jean de Jérusalem s'y est installé pour gérer un hôpital pour pèlerins.

Construite au XIIIe siècle, sa construction a été réalisée par l'un des principaux collaborateurs de Maître Mateo, connu pour ses travaux sur la cathédrale de Santiago. À l'origine, l'église était située près de la rivière Miño, à un endroit stratégique sur le Chemin français, mais elle a été déplacée dans les années 1950 à son emplacement actuel en raison de la construction du barrage de Belesar. Les pierres de taille numérotées témoignent encore de sa reconstruction.

Le temple a l'aspect d'une église-forteresse, avec une seule nef et un chœur semi-circulaire. La façade principale, qui imite une structure défensive, présente des créneaux, des archères et des tours des deux côtés. Il y a un grand arc, divisé par une tornalluvie, et une imposante rosace, l'une des plus grandes de Galice. Le portique principal, avec ses trois archivoltes décorées, s'inspire de l'atelier du maître Mateo. L'archivolte intérieure représente les vingt-quatre vieillards de l'Apocalypse jouant des instruments, tandis que le tympan uni abrite la figure du Pantocrator. Les chapiteaux des colonnes sont décorés de motifs végétaux.

Les portes latérales nord et sud sont également conservées. Le tympan de la porte nord montre l'Annonciation, tandis que la porte sud représente un personnage portant une mitre et une chasuble. Les deux portes sont dotées d'archivoltes richement ornées.

L'intérieur de l'église est sobre et élégant, avec une nef couverte d'une voûte en berceau brisé, et le chœur avec des voûtes en berceau et en coquille. Une rosace dans l'arc triomphal éclaire la nef. De chaque côté, deux baldaquins encadrent l'entrée.

Deux escaliers à vis, situés de part et d'autre de la porte principale, conduisent à un couloir sous la rosace et à un chemin de ronde crénelé qui entoure les quatre tours.

L'église de San Juan de Portomarín est considérée comme l'un des meilleurs exemples de l'architecture romane galicienne et a été déclarée Monument historique et artistique en 1931.