La crypte de Santa Leocadia est l'un des vestiges les plus anciens de l'ensemble de bâtiments palatiaux et ecclésiastiques qui existaient dans la région à l'époque d'Alfonso II ; chaste dont fait également partie l'église de San Tirso, bien que la construction de la crypte soit attribuée à Alfonso III.

La crypte faisait partie d'un ensemble de deux sanctuaires superposés, mais sans communication entre eux ; la crypte est le sanctuaire inférieur et le sanctuaire supérieur est la Chambre Sainte.