Le marché central de San Pedro, situé au cœur du centre historique, est non seulement le marché le plus important de la ville, mais aussi le plus ancien. Il se trouve en face de la Plazoleta San Pedro et de la rue Santa Clara, qui suit le tracé d'une ancienne route inca qui reliait la capitale du Tawantinsuyo à la région de Contisuyo, à partir de la Huacaypata, la place centrale inca.

L'histoire du marché remonte à la fin des années 1910, sous l'administration de Manuel Silvestre Frisancho, alors maire de Cusco et député. Frisancho a encouragé le transfert du marché de la Plaza de Armas et de la Plaza San Francisco, où se déroulaient traditionnellement les transactions d'approvisionnement de la ville, vers le quartier de San Pedro, à l'ouest de la ville. Le nouveau site choisi est la "pampa de Qasqaparo", un terrain appartenant au couvent de Santa Clara, situé en face de l'église de San Pedro. À l'époque, cette zone abritait déjà l'abattoir municipal, et la décision d'y déplacer le marché a été motivée principalement par des préoccupations sanitaires.

La construction du marché s'est déroulée en deux phases. La première phase a débuté en 1925 et le marché a été inauguré le 7 juin de la même année, date à laquelle il a commencé à fonctionner en tant que tel. Cependant, la construction complète du marché n'a été achevée qu'en 1950. La partie la plus ancienne de la structure a été conçue par l'ingénieur civil français Gustave Eiffel, qui a été contacté par le maire Frisancho pour le projet. En son temps, la structure est devenue la plus grande surface couverte construite à Cusco et a été populairement connue sous le nom de "Mercado Frisancho". Emilio Astete en fut le premier administrateur.

En 1955, après le tremblement de terre de 1950 et la croissance démographique de Cusco qui en a résulté, le bâtiment a été agrandi, ce qui a impliqué la démolition du bloc sud du marché. À partir de ce moment, le marché San Pedro s'est consolidé comme le principal noyau commercial de la ville, générant un grand dynamisme dans les rues environnantes.

La structure de l'édifice est remarquable par sa conception néoclassique et est construite principalement en fer, avec un toit en calamine, des portes à grille métallique, des murs et des sols en béton. Le toit, à trois niveaux et à pignon, est soutenu par une série de colonnes réparties le long du bloc rectangulaire. Les colonnes, dont les dimensions varient en fonction de leur emplacement, sont plus hautes au centre et diminuent en hauteur et en épaisseur vers les côtés, qui sont tous revêtus de béton. Les fermes en fer sont assemblées à l'aide de rivets thermoserrés, ce qui garantit la solidité de la construction. De plus, les poutres de tension et les poutres en ciseaux, fabriquées en pin d'Araucanie et en pin d'Oregon importés, complètent cette structure ingénieuse. La deuxième phase du marché, située au sud-est et destinée à la vente d'aliments préparés, a fidèlement conservé la conception originale.

Au fil des ans, le Mercado de San Pedro est passé d'un marché alimentaire traditionnel à un marché à vocation touristique. Aujourd'hui, il compte 1180 stands, ce qui génère un important mouvement commercial à l'intérieur du marché et dans les rues adjacentes. Le marché est organisé en blocs qui se distinguent par le type de produits qu'ils proposent, depuis l'épicerie, la viande, les fruits et légumes, jusqu'aux vêtements et aux articles liés au chamanisme andin. Ce marché est devenu un point de référence non seulement pour les résidents locaux, mais aussi pour les touristes à la recherche d'une expérience authentique dans la ville de Cusco.