Il a été créé par Philippe II, un homme qui aimait la nature, et constitue un endroit idéal pour la réflexion. Ce monastère est mentionné par Manuel Azaa, qui y a fréquenté l'école des frères augustins, à la fois dans ses mémoires et dans le livre El jardn de los frailes (Le jardin des frères). Pour les élèves, il sert à la fois d'espace d'étude et de récréation. Les jardins appartenaient au roi, qui y voyait un lieu de culture de fruits, de légumes et de plantes médicinales ainsi qu'un lieu de beauté avec des fontaines et des fleurs. Le monarque engageait les meilleurs jardiniers, étrangers et espagnols, et collectionnait les plans de jardins de France, d'Italie, d'Angleterre et des Pays-Bas. Ce jardin, désormais spartiate, était autrefois couvert de fleurs, créant une sorte de tapisserie, et de ce fait, il était comparé aux tapis apportés de Turquie ou de Damas. En outre, c'était un véritable jardin botanique avec 400 plantes importées du Nouveau Monde, jusqu'à 68 espèces de fleurs différentes, dont beaucoup étaient thérapeutiques.

La galerie des convalescents ou couloir du soleil, un vaste espace lumineux créé pour le repos des malades, est située au sud-ouest du jardin. Peut-être en raison de l'obligation d'assurer la clôture des moines, elle est soutenue par la tour de l'apothicairerie. La façade sobre orientée vers l'ouest contraste avec la façade plus ouverte donnant sur les jardins, où la solution des arcs au-dessus des colonnades ioniques est unique dans le monastère.